【AI辅助分子模拟】开篇—AI驱动下的模拟技术发展和学习方法
2026/9/9 20:42:31 网站建设 项目流程

关注M r . m a t e r i a l , \color{Violet} \rm Mr.material\ ,Mr.material,更 \color{red}{更}多 \color{blue}{多}精 \color{orange}{精}彩 \color{green}{彩}


主要专栏内容包括:
†《LAMMPS小技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag《LAMMPS小技巧》:}}LAMMPS小技巧》:主要介绍采用分子动力学(L a m m p s LammpsLammps)模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧(难度:★ \bigstar
††《LAMMPS实例教程—In文件详解》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag《LAMMPS实例教程—In文件详解》:}}††LAMMPS实例教程—In文件详解》:主要介绍采用分子动力学(L a m m p s LammpsLammps)模拟相关物理过程模拟。(包含:热导率计算、定压比热容计算,难度:★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:}}†††Lammps编程技巧及后处理程序技巧》:主要介绍针对分子模拟的动力学过程(轨迹文件)进行后相关的处理分析(需要一定编程能力。难度:★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar)。
††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:}}††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》:主要介绍针对后处理过程中指定函数,进行包装,方便使用者直接调用(需要一定编程能力,难度:★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar)。
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:}}†††††SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》:主要介绍针对处理后的数据可视化,并提供对应的绘图模板(需要一定编程能力,难度:★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar★ \bigstar)。
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》: ‾ \textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:}}††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》:主要采用O v i t o \rm OvitoOvito软件,对L a m m p s \rm LammpsLammps生成的轨迹文件进行渲染(难度:★ \bigstar★ \bigstar)。

专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文): ‾ \color{red}{\textbf{ \underline{专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):}}}专栏说明(订阅后可浏览对应专栏全部博文):
注意: \color{red} 注意:注意:如需只订阅某个单独博文,请联系博主邮箱咨询。l a m m p s _ m a t e r i a l s @ 163. c o m \rm lammps\_materials@163.comlammps_materials@163.com

♠ \spadesuit† \dag开源后处理集成程序:请关注专栏《LAMMPS后处理——MATLAB子函数合集整理》
♠ \spadesuit† \dag† \dag需要付费定制后处理程序请邮件联系:l a m m p s _ m a t e r i a l s @ 163. c o m \rm lammps\_materials@163.comlammps_materials@163.com

建模篇:分子动力学模型快速构建 \rm 建模篇:分子动力学模型快速构建建模篇:分子动力学模型快速构建

M a t e r i a l S t u d i o + M o l t e m p l a t e + P a c k m o l \rm \color{red} Material\ Studio+Moltemplate+PackmolMaterialStudio+Moltemplate+Packmol

1、建模篇(上):OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate

2 、建模篇(下):力场快速设置-AuToFF+Moltemplate


题目


【未完-更新较慢请谅解】

杂记

该博文主要记录学习AI技术,尤其是在通过AI技术加速模拟,甚至实现极大程度的“无人”化下,因为目前AI技术的发展速度,博主还未关注到有相关、系统的课程资料,只用于记录博主的一些学习经历和思考,所以就以博主遇到的具体问题来分析。

在开始之前,想谈一谈自己对于AI的一些体会,博主在GPT-3.0的时候就开始关注大模型的发展,主要用于处理一些文字工具,论文润色,翻译,那时候对大模型的理解就是用维基百科等训练的一些文字工具,即,输出下一个可能出现的字的最大概率。

也就是Transform架构,为什么会出现这个架构呢?为了解决长短期神经网络中只能串行处理数据的问题,也就是知道t tt+1 时刻的情况,就必须要计算t tt时刻的数据,这样也就无法利用N卡进行大数据训练。似乎在此之前从未有神经网络模型提到大数据训练,由于梯度爆炸、串行等问题。但解决这个之后,我们发现线性法则适用于大模型,数据越大,参数越多,模型越大越好。这有点类似深度神经网络了,神经网络套神经网络=深度神经网络。


此时,出现的GPT在解决问题,语言润色,推理能力上均展现出巨大的潜力,也从实验室彻底走出来了,成为资本的新宠,英伟达的卡也水涨船高。直到Deepseek(DS)的出现,巨大的降低了训练成本,并且史无前例的开源了模型。那时候记得Deepseek被接入各种平台,各种应用,这也是开源的独有魅力吧!

这时候异军突起的是初代的工作流,N8N,Dify,个人数据库,等等,逻辑也很简单,把重复的、简单的、具有固定模式的工作,给AI学习,形成“工作”流。

这时候至关重要的就是“提示词”,甚至有了“提示词工程师“。因此,我也开始了一系列的,提示词研究,原因也很简单,不可能去实际训练一个大模型,或者调节底层参数。我只能通过“提示词” prompt 用于微调大模型,让大模型“向量匹配”过程更加准确。也看了很多教程和讲座,那时候我高度认可,人和AI相处的模式可以划分在下面的象限里。1、人知道-AI也知道的事情:简单提问;2、人不知道,AI知道,直接问;3人不知道,AI也不知道(类似宇宙的便边界在哪里),我认为这属于天才领域;4、人知道-AI不知道(例如,撰写科研论文,处理科研工作,没有专门垂类在戈特定领域的大模型,只能去微调),因此,这也是我研究的重点。开发了针对不同工作的“提示词”,具体的效果还不错。

中间因为个人原因,搁置了一段时间的学习。后面,猛追了一波,C l a u d e C L I Claude\ CLIClaudeCLI等等。蒸馏模型是一个很有意思的工作,就是我不知道模型A AA的训练过程,但是我不断地去访问模型A AA,并且得到回复,认真记录,再用这个过程去训练模型B BB,得到模型A的蒸馏模型。

但总体来说,还是模型电力、工业设施,直接决定了大模型的成本(T o k e n TokenToken), 总的来说还是穷,囊中羞涩~

由于文字更新较慢,改为B站更新~

开篇内容:AI4Science分子模拟智能体搭建(一)开篇

开篇内容:AI4Science分子模拟智能体搭建(二)开篇

AI4Science分子模拟智能体搭建(三):MD Exp智能体实战-储能材料动力学模拟复现

需要专业的网站建设服务?

联系我们获取免费的网站建设咨询和方案报价,让我们帮助您实现业务目标

立即咨询