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20240703

结构优化

在优化中出现l9999错误，可能结构在优化过程中出现了震荡，无法达到收敛限，可以尝试一下方法：

从实用性出发，对于大多数情况，对于初学者笔者推荐按照以下顺序去尝试解决震荡问题：

1 对于DFT，特别是明尼苏达系列泛函（如M062X、M06、M06L），首先加上int=ultrafine再试（从G16开始此为默认，不再需要尝试此项）。如果用了SMD，改用IEFPCM
2 如果体系小，尝试opt=calcall。如果体系大算得慢，此关键词会令计算量进一步激增，实在没辙再考虑这个，或者尝试opt=recalc=3或5
3 尝试opt=gdiis
4 尝试opt(gdiis,maxstep=x,notrust)，x为3~5
5 如果上述做法都不灵，干脆改成loose收敛限，但如果之后做振动分析容易有虚频

 http://sobereva.com/164

如改为：

# opt=gdiis b3lyp/3-21+g* scrf=(iefpcm,solvent=water) em=gd3bj

采用em=gd3bj加色散校正。

可以将失败的log文件导入gaussianview，勾选read intermediate geometries(optimizations)，可以在右键中看能量，力的波动情况，并观看结构随优化的变化。

结合能计算

对于复合物，通常在相同级别下分别优化复合物以及各个单体，再在相同级别下计算这几个部分的单点能，然后将复合物的单点能减去各个单体的单点能即可。

将一个分子复制到其他文件中，通过移动单体的位置（alt+鼠标中键、al