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3分钟上手Boltz-1：Fasta文件快速预测蛋白质结构实例

Boltz-1是一款强大的开源模型，能够快速预测蛋白质、RNA、DNA和小分子的3D结构，支持修饰残基、共价配体和聚糖，甚至可以基于口袋残基进行生成条件控制。本文将带您快速掌握使用Fasta文件进行蛋白质结构预测的方法。

🚀 一键安装Boltz-1

安装Boltz-1非常简单，推荐使用PyPI安装：

pip install boltz

如果您需要获取每日更新，也可以直接从GitHub克隆仓库：

git clone https://gitcode.com/hf_mirrors/boltz-community/boltz-1 cd boltz-1; pip install -e .

注意：建议在全新的Python环境中安装Boltz-1，以避免依赖冲突。

📁 准备Fasta文件

Boltz-1支持多种输入格式，其中Fasta文件是最常用的格式。Fasta文件是一种文本格式，用于表示核酸或蛋白质序列。您可以使用任何文本编辑器创建Fasta文件，也可以从公共数据库下载已知蛋白质的Fasta序列。

🔍 执行蛋白质结构预测

准备好Fasta文件后，只需一行命令即可开始预测：

boltz predict input_path

其中input_path是您的Fasta文件路径。Boltz-1会自动处理序列并生成3D结构预测结果。

如果您需要查看所有可用选项，可以运行：

boltz predict --help

📊 了解预测结果

预测完成后，Boltz-1会生成包含蛋白质3D结构的输出文件。您可以使用分子可视化软件（如PyMOL、VMD等）打开这些文件，查看预测的蛋白质结构。

📚 更多资源

• 预测详细说明：docs/prediction.md
• 训练模型指南：docs/training.md

Boltz-1的模型和代码基于MIT许可证发布，可自由用于学术和商业目的。如果您有任何问题或想参与贡献，欢迎加入社区Slack频道与开发团队交流。

很快，Boltz-1还将支持口袋条件控制、提供更多示例、完整的数据处理管道以及Colab推理笔记本等功能，敬请期待！